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苗期主要病害有:猝倒病、立枯病、霜霉病、灰霉病、病毒病、菌核病、疫病等;由环境因素引起的生理性病害有:冻害、热害、烧苗、旱害、盐害、涝害、沤根、有害气体毒害、药害等。
病害以预防为主,做好综合防治,提高幼苗素质,控制育苗环境,及时调整并杜绝各种传染途径,做好育苗器具、种子、工作人员及育苗环境的消毒,再辅以经常检查,尽早发现病害,及时进行化学防治。
漂浮蔬菜育苗基质在相对较密闭的环境,一般都安装有防虫网,所以出现的虫害很少,如果出现虫害要及时使用化学农药进行防治。
一般常用药剂有:75%百菌清、64%杀毒矾、72%普力可等;严禁使用剧毒、高毒农药;出口蔬菜要严格按要求使用化学农药,提倡施用生物农药。